Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbsponQ3UPR9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms