Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sec31aQ3UPL0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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