Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Skap2Q3UND0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms