Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm648Q3UJ22 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm648Q3UJ22 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm648Q3UJ22 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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