Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf224Q3UIW8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf224Q3UIW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms