Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trafd1Q3UDK1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trafd1Q3UDK1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms