Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ssbp4Q3U4B1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ssbp4Q3U4B1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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