Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms