Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LcorlQ3U285 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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