Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc174Q3U155 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc174Q3U155 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms