Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms