Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tbc1d2bQ3U0J8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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