Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hace1Q3U0D9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hace1Q3U0D9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms