Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Srsf6Q3TWW8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Srsf6Q3TWW8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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