Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms