Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdlim7Q3TJD7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms