Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Colec11Q3SXB8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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