Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam178bQ24JP3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam178bQ24JP3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam178bQ24JP3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam178bQ24JP3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam178bQ24JP3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms