Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp2b3Q0VF55 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms