Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf541Q0GGX2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Znf541Q0GGX2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms