Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gata4Q08369 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gata4Q08369 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms