Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgm3Q08189 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms