Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
F13bQ07968 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
F13bQ07968 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
F13bQ07968 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
F13bQ07968 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
F13bQ07968 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
F13bQ07968 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms