Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cntn3Q07409 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms