Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Siah2Q06986 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Siah2Q06986 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms