Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Siah1bQ06985 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Siah1bQ06985 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms