Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox12Q04890 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox12Q04890 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms