Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NfiaQ02780 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms