Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ascl1Q02067 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms