Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gja5Q01231 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms