Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Grin2cQ01098 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Grin2cQ01098 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms