Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms