Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Il6stQ00560 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Il6stQ00560 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms