Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Irx1P81068 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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