Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms