Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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