Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf3P70671 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf3P70671 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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