Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tp53bp1P70399 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms