Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pkn1P70268 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pkn1P70268 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms