Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hoxd13P70217 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd13P70217 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd13P70217 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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