Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps3P62908 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps3P62908 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms