Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ube2d1P61080 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ube2d1P61080 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms