Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PlnP61014 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PlnP61014 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PlnP61014 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PlnP61014 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms