Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snap25P60879 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snap25P60879 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms