Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CgnP59242 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CgnP59242 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CgnP59242 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CgnP59242 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms