Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl3P58873 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl3P58873 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms