Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P58686 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P58686 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
P58686 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P58686 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
P58686 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms