Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm9sf2P58021 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm9sf2P58021 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms