Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CtnsP57757 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtnsP57757 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtnsP57757 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms