Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gsc2P56916 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gsc2P56916 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms